Wie ich vor einiger Zeit schon geschrieben habe, macht Ubuntu immer wieder mal Zicken bei der grafischen Oberfläche. Heute war mein Problem tiefer liegend und ein Neustart von unity (oder compiz) hat leider nicht weitergeholfen. In diesem Fall hilft es nur noch, den X-server durchzustarten:
Mittels Ctrl-Alt-F1 auf die Konsole wechseln und mit einem Nutzer, der zu den sudoers gehört anmelden. Gibt man nun
sudo killall Xorg
ein startet das System in aller Regel sofort den X-server neu. Manchmal ist es dann noch nötig, sich an der grafischen Oberfläche ab- und wieder an zu melden, damit die persönlichen Einstellungen korrekt geladen werden.
Viel Erfolg!